Esta Comissão (Comissão Externa Permanente de Aconselhamento Científico) tem como funções o acompanhamento e aconselhamento dos projectos de investigação e da actividade científica do CHAM. A sua constituição observa as normas do regulamento da Fundação para a Ciência e a Tecnologia para as Unidades de Investigação.
Arno Alvarez Kern . Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul
Dejanirah Couto . École Pratique des Hautes Études
Fernando José de Almeida Catroga . Faculdade de Letras - Universidade de Coimbra
Joaquín Córdoba Zoilo . Universidad Autónoma de Madrid
Juan Marchena . Universidad Pablo de Olavide
Maria Fernanda Baptista Bicalho . Universidade Federal Fluminense
Roger Chartier . Collège de France
Roquinaldo Ferreira . Brown University
Sabine du Crest . Université Michel de Montaigne (Bordeaux III)